Isolement, identification et culture des champignons endophytes isolés à partir des plantes médicinales algériennes pour la production des métabolites secondaires biologiquement actifs

Abstract

Le but de cette étude est d'isoler et d'identifier les champignons en dophytes de deux espèces végétales Juniperus oxycedrusL. et Pistacia lentiscusL. afin d’évaluer leurs activités biologiques. Après le screening préliminaire et selon l’intensité d’inhibition, le spectre d’activité, et le morphotype des isolats, 6 isolats ont été sélectionnés pour poursuivre cette étude. Les isolats PLR9, JOR22 et PLT7 ont été identifiés comme étant appartenir aux espèces, Aspergillusneobridgeri, Penicillium griseofulvumet Micronematobotrys verrucosus respectivement. Les souches PLT8 et PLF5 ont été proposées comme étant une nouvelle espèce appartenant au genre Neocucurbitaria, alors que l’isolat JOR26 a été proposé comme une nouvelle famille de l’ordre des Diaporthales. L’optimisation de certaines conditions culturales pour améliorer la production et l’extraction maximale des composés bioactifs, a montré que le MEA était le meilleur milieu donnant la meilleure production pour les isolats PLR9, JOR22, PLT8 et PLF5, le PDA pour l’isolat PLT7 et le YMEA pour l’isolat JOR26. L’acétate d’éthyle était le meilleur solvant organique permettant une extraction maximale des composés bioactifs pour tous les isolats. La production des molécules bioactives sur milieu liquide était plus efficace que celle en milieu solide pour les isolats JOR26, JOR22, PLT7 et PLR9, alors que pour les souches PLT8 et PLF5,la production était meilleureaprès fermentation sur milieu solide. Les extraits des isolats PLT8, PLF5, PLT7 et JOR26 étaient actifs uniquement contre les bactéries à Gram positif, contrairement aux extraits des isolats PLR9 et JOR22 qui étaient actifs contre les deux groupes de bactéries. Pour l’activité antifongique, uniquement les extraits des isolats PLT7, JOR22 et JOR26 étaient actifs. En se basant sur les valeurs des CMI, les extraits des isolats JOR26 et PLT8 étaient les plus efficaces, suivis par les extraits de PLT7 et PLF5 et enfin les extraits de JOR22et PLR9. L’étude de la cinétique de létalité des extraits a montré que les extraits des isolats JOR26, PLT7 et JOR22 avaient un effet bactéricide, ceux des souches PLT8 et PLF5 avaient un effet bactériostatique, alors que l’effet de l'extrait de PLR9 était bactéricide contre E. faecium1 et bactériostatique contre A.baumannii. Pour l’activité antioxydante, Les trois extraits PLT7, PLT8 et JOR22 se sont avérés être les plus efficaces en présentant une activité antioxydante in vitro dans les diverses méthodes utilisées. Cependant, les extraits restants des JOR26, PLF5 et PLR9 ont montré les activités les moins efficaces.