Recherche de nouveaux taxons d’actinobactéries halophiles des sols sahariens et potentialités antagonistes

Abstract

Des travaux ont été entrepris sur la taxonomie et les potentialités antagonistes des actinobactéries halophiles des sols salés des régions du M’zab, de Biskra, de M’sila et de Boughezoul (Médéa) en vue de rechercher de nouveaux taxons et de déceler des souches à activités antibiotiques intéressantes contre divers microorganismes pathogènes. Vingt quatre échantillons de sols modérément salés à très salés ont été prélevés au niveau de ces régions puis analysés. Les actinobactéries ont été dénombrées et isolées sur milieux « complexe medium agar » et « chitinevitamines agar » contenant chacun 15 et 20% de NaCl. Au total, 91 souches d’actinobactéries halophiles ont été prélevées et ont fait l’objet d’une étude taxonomique polyphasique, sur la base des caractéristiques morphologiques, physiologiques, chimiques et moléculaires (séquençage du gène codant pour l’ARNr 16S et études phylogénétiques). Les résultats ont montré la présence de 7 genres, dont 6 sont connus: Actinopolyspora, Nocardiopsis, Prauserella, Saccharomonospora, Saccharopolyspora et Streptomonospora, et un genre nouveau appelé Mzabimyces.Trois Nouvelles espèces ont été obtenues: Mzabimyces algeriensis (appartenant à un nouveau genre et une nouvelle famille, Mzabimycetaceae), Actinopolyspora biskrensis et Prauserella isguenensis. Les potentialités antagonistes des 91 souches d’actinobactéries halophiles ont été évaluées sur milieu ISP2 vis-à-vis de neuf microorganismes (bactéries, levures et champignons filamenteux) dont la plupart sont pathogènes ou toxinogènes pour l’Homme, ou encore phytopathogènes. Les résultats ont montré que 69 souches ont une activité antibiotique (surtout antifongique). Sur les 22 souches inactives, 19 possèdent au moins un type de gène pour la production de molécules bioactives, surtout les PKS-II et les NRPS.