Dépistage et utilisation des rhizobactéries antagonistes (Pseudomonas et Bacillus) dans la lutte biologique contre la fusariose du pois chiche induite par Fusarium oxysporum f.sp. cice

Abstract

L’objectif de ce travail est d'étudier la capacité des souches rhizobactériennes appartenant aux genres Pseudomonas et Bacillus prélevées à partie des principales zones de culture du pois chiches en Algérie, dans le biocontrôle de la croissance mycélienne du Fusarium oxysporum f.sp.ciceris. Les tests d'inhibition antifongiques in vitro réalisés avec 152 souches bactériennes ont montré que 66 souches possèdent une activité antifongique élevée contre Fusarium oxysporum f.sp.ciceris. Ces souches ont été par la suite caractérisées à travers des tests pour la production des composés extracellulaires diffusibles et volatiles tels que la Cellulase, la Chitinase, la Protéase, l’Amylase, la Lipase, la Phosphatase, les sidérophores, le cyanure d'hydrogène (HCN), l'acide acétique indole (AIA) et la production d'Ammoniac. Les résultats montrent que les souches affiliées au genre des Pseudomonas sont fortement productrices des métabolites comme la phosphatase, AIA et les Sédirophres. Alors que les souches affiliées au genre des Bacillus sont fortement productrices des enzymes exocellulaires telles que la chitinase, cellulase, et les protéases. Aussi, les résultats de la confrontation directe montrent que l'inhibition de la croissance mycélienne du FOC est le résultat de l'action combinée des composés volatiles et des produits diffusibles. En ce qui concerne l'action des produits diffusibles, très peu de différence existe entre les deux groupes de Bacillus et de Pseudomonas et leurs espèces apparentées. En revanche, l'action des substances volatiles produites par les souches de Bacillus est plus prononcée que celle obtenue avec les souches de Pseudomonas. D’une manière générale, la sensibilité des isolats du FOC, elle à l'avantage des produits volatile par rapport aux produits diffusibles. L’identification des souches bactériennes basée sur l’API 50 CHB, a mis en évidence la présence de neuf espèces de Bacillus et espèce apparentées à savoir B.subtilis ; B.lentus ; B.cereus ; B.circulans ; B. licheniformis ; B. firmus ; B. amyloliquefaciens ; Brevisbacillus laterosporus and Aneurinibacillus aneurinilyticus et l’utilisation des galeries API 20 NE a montré l’existence de cinq espèces de Pseudomonas et espèces apparentées à savoir Pseudomonas luteola, P. aeruginosa, P. fluorescens, Sentrophormonas maltophilia et Sphingomonas paucimobilis. Les tests de pathogénicité montrent que les isolats FOC1 et FOC2 sont les plus pathogènes à travers la série de symptômes induits, allant du flétrissement latéral au desséchement total du plant infecté. Par ailleurs, dans des tests in planta de biocontrôle des plants de pois chiche infectés artificiellement par le FOC1 et le FOC2 à travers l’utilisation des souches rhizobactériennes, les données ont changé radicalement en comparaison avec les résultats des tests in Vitro. En général, les performances de protection sont corrélées significativement avec les résultats de production des différents produits diffusibles et volatiles impliquées dans le biocontrôle.